Arbeitsgruppe Molekulare Marker

Molekulare Marker haben sich zu einem unverzichtbaren Instrument der Züchtungsforschung entwickelt um sowohl den Erkenntnisfortschritt, als auch die Materialentwicklung schneller voranzubringen. Die Arbeitsgruppe unterstützt die kulturartenorientierten Gruppen des Institutes und leistet ihre Beiträge bei:

• Distanzanalysen unter Einbeziehung von Genbankmaterial und aktuellen Sorten
• Nachweis des Erfolgs weiter Artkreuzungen
• Erstellung genetischer Karten
• Entwicklung chromosomenspezifischer Marker
• QTL-Analysen
• Physische Kartierung mittels Radiation Hybrids (RH) Mapping
• Molekulare Charakterisierung von Erregermaterial

Zumeist werde folgende PCR-gestützte Methode für diese Aufgaben verwendet:

• RAPD (random amplified polymorphic DNA)
• double primer (dp)RAPD
• AFLP (amplified fragment length polymorphism)
• SRAP (sequence-related amplified polymorphism)
• SSR (simple sequence repeat)

Die Auftrennung und Detektion der amplifizierten DNA erfolgt entweder mittels denaturierender PAGE (Polyacrylamid-Gelelektrophorese) und anschließender Silberfärbung oder über einen LI-Cor 4300S. Für Kartierung, QTL- und Distanzanalysen wurden jeweils mehrere Computerprogramme vergleichend getestet